Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Grk3-204ENSMUST00000197888 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprmP28828 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Gm12681-201ENSMUST00000132337 700 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Gm8384-201ENSMUST00000190905 704 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Gm37851-201ENSMUST00000193871 889 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Tmod3-205ENSMUST00000215821 898 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprmP28828 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Crygf-201ENSMUST00000027082 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Gm9791-201ENSMUST00000060997 447 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Gm8181-201ENSMUST00000062242 669 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprmP28828 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Cfap61-201ENSMUST00000116398 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprmP28828 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Gm12461-201ENSMUST00000120231 1239 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Gm15196-201ENSMUST00000121406 482 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Polr3c-205ENSMUST00000141377 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Gm20822-201ENSMUST00000165756 687 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprmP28828 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprmP28828 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprmP28828 AC158392.3-201ENSMUST00000224271 1284 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprmP28828 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprmP28828 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Gm15707-201ENSMUST00000118804 996 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprmP28828 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Scgb2b7-201ENSMUST00000178258 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprmP28828 4930578M01Rik-201ENSMUST00000180490 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Gm26875-201ENSMUST00000181006 950 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Mpzl1-203ENSMUST00000191818 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprmP28828 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprmP28828 AC152169.1-201ENSMUST00000223901 701 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Gm7735-201ENSMUST00000089098 159 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprmP28828 AU016765-201ENSMUST00000097295 946 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprmP28828 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Ighv1-5-201ENSMUST00000103494 294 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Gm23604-201ENSMUST00000104311 132 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Saxo2-202ENSMUST00000126478 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Tsc22d1-207ENSMUST00000140251 670 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Pigx-212ENSMUST00000215073 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprmP28828 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
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