Protein–RNA interactions for Protein: P28312

Defa5, Alpha-defensin 5, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa5P28312 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Defa5P28312 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Defa5P28312 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Defa5P28312 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Defa5P28312 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Defa5P28312 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Defa5P28312 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Defa5P28312 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Defa5P28312 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Defa5P28312 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Defa5P28312 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Defa5P28312 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Defa5P28312 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Defa5P28312 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Defa5P28312 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Defa5P28312 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Defa5P28312 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Defa5P28312 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Defa5P28312 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Defa5P28312 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Defa5P28312 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Defa5P28312 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Defa5P28312 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Defa5P28312 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Defa5P28312 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Defa5P28312 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Defa5P28312 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Defa5P28312 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Defa5P28312 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Defa5P28312 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Defa5P28312 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Defa5P28312 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Defa5P28312 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Defa5P28312 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Defa5P28312 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Defa5P28312 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Defa5P28312 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Defa5P28312 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Defa5P28312 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Defa5P28312 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Defa5P28312 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Defa5P28312 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Defa5P28312 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Defa5P28312 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Defa5P28312 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Defa5P28312 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Defa5P28312 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Defa5P28312 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Defa5P28312 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Defa5P28312 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Defa5P28312 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Defa5P28312 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Defa5P28312 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Defa5P28312 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Defa5P28312 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Defa5P28312 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Defa5P28312 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Defa5P28312 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Defa5P28312 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Defa5P28312 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Defa5P28312 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Defa5P28312 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Defa5P28312 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Defa5P28312 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Defa5P28312 Myh9-201ENSMUST00000016771 7433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Defa5P28312 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Defa5P28312 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Defa5P28312 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Defa5P28312 Otog-201ENSMUST00000164538 10043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Defa5P28312 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Defa5P28312 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Defa5P28312 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Defa5P28312 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Defa5P28312 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Defa5P28312 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Defa5P28312 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Defa5P28312 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Defa5P28312 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Defa5P28312 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Defa5P28312 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Defa5P28312 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Defa5P28312 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Defa5P28312 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Defa5P28312 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Defa5P28312 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Defa5P28312 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Defa5P28312 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Defa5P28312 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Defa5P28312 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Defa5P28312 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Defa5P28312 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Defa5P28312 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Defa5P28312 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Defa5P28312 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Defa5P28312 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Defa5P28312 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Defa5P28312 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Defa5P28312 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Defa5P28312 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Defa5P28312 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms