Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Psmb9P28076 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms