Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Gm5149-202ENSMUST00000199980 1250 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ChgaP26339 2900064F13Rik-201ENSMUST00000202166 1008 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ChgaP26339 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ChgaP26339 1700011I03Rik-201ENSMUST00000079738 1013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ChgaP26339 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Gm12467-201ENSMUST00000117625 745 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ChgaP26339 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ChgaP26339 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ChgaP26339 4930551O13Rik-201ENSMUST00000145585 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Gm3344-201ENSMUST00000169610 603 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Ackr1-202ENSMUST00000194046 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ChgaP26339 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ChgaP26339 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChgaP26339 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChgaP26339 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Gm15875-201ENSMUST00000152264 273 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChgaP26339 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Gm19212-201ENSMUST00000216642 862 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Gm39375-201ENSMUST00000217068 1039 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ChgaP26339 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChgaP26339 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ChgaP26339 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms