Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
PparaP23204 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
PparaP23204 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
PparaP23204 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PparaP23204 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
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PparaP23204 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PparaP23204 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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PparaP23204 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PparaP23204 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
PparaP23204 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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PparaP23204 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PparaP23204 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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PparaP23204 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PparaP23204 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PparaP23204 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PparaP23204 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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PparaP23204 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PparaP23204 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PparaP23204 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PparaP23204 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PparaP23204 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
PparaP23204 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
PparaP23204 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PparaP23204 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
PparaP23204 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PparaP23204 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
PparaP23204 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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PparaP23204 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
PparaP23204 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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PparaP23204 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PparaP23204 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PparaP23204 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PparaP23204 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PparaP23204 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PparaP23204 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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PparaP23204 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PparaP23204 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PparaP23204 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
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PparaP23204 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PparaP23204 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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PparaP23204 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PparaP23204 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PparaP23204 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PparaP23204 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PparaP23204 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PparaP23204 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PparaP23204 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PparaP23204 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PparaP23204 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PparaP23204 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PparaP23204 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PparaP23204 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PparaP23204 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PparaP23204 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PparaP23204 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PparaP23204 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PparaP23204 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PparaP23204 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PparaP23204 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PparaP23204 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PparaP23204 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PparaP23204 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PparaP23204 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PparaP23204 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PparaP23204 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
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