Protein–RNA interactions for Protein: P22518

Clk1, Dual specificity protein kinase CLK1, mousemouse

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Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk1P22518 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Clk1P22518 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Clk1P22518 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Clk1P22518 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Clk1P22518 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Clk1P22518 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Clk1P22518 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Clk1P22518 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Clk1P22518 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Clk1P22518 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Clk1P22518 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Clk1P22518 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Clk1P22518 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Clk1P22518 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Clk1P22518 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Clk1P22518 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Clk1P22518 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Clk1P22518 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Clk1P22518 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Clk1P22518 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Clk1P22518 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Clk1P22518 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Clk1P22518 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Clk1P22518 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Clk1P22518 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Clk1P22518 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Clk1P22518 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Clk1P22518 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Clk1P22518 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Clk1P22518 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Clk1P22518 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Clk1P22518 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Clk1P22518 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Clk1P22518 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Clk1P22518 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Clk1P22518 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Clk1P22518 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Clk1P22518 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Clk1P22518 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Clk1P22518 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Clk1P22518 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Clk1P22518 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Clk1P22518 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Clk1P22518 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Clk1P22518 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Clk1P22518 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Clk1P22518 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Clk1P22518 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Clk1P22518 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Clk1P22518 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Clk1P22518 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Clk1P22518 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Clk1P22518 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Clk1P22518 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Clk1P22518 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Clk1P22518 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Clk1P22518 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Clk1P22518 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Clk1P22518 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Clk1P22518 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Clk1P22518 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Clk1P22518 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Clk1P22518 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Clk1P22518 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Clk1P22518 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Clk1P22518 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Clk1P22518 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Clk1P22518 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Clk1P22518 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Clk1P22518 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Clk1P22518 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
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Clk1P22518 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Clk1P22518 Gm5403-201ENSMUST00000117105 2795 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Clk1P22518 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Clk1P22518 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Clk1P22518 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Clk1P22518 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Clk1P22518 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Clk1P22518 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Clk1P22518 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Clk1P22518 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Clk1P22518 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Clk1P22518 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Clk1P22518 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Clk1P22518 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Clk1P22518 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Clk1P22518 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Clk1P22518 Zkscan6-201ENSMUST00000018491 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Clk1P22518 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Clk1P22518 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Clk1P22518 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Clk1P22518 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Clk1P22518 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Clk1P22518 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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