Protein–RNA interactions for Protein: P21271

Myo5b, Unconventional myosin-Vb, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5bP21271 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Myo5bP21271 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Myo5bP21271 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Myo5bP21271 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Myo5bP21271 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Myo5bP21271 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Myo5bP21271 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Myo5bP21271 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Myo5bP21271 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Myo5bP21271 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Myo5bP21271 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Myo5bP21271 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Myo5bP21271 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Myo5bP21271 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Myo5bP21271 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Myo5bP21271 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Myo5bP21271 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Myo5bP21271 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Myo5bP21271 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Myo5bP21271 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Myo5bP21271 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Myo5bP21271 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Myo5bP21271 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Myo5bP21271 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Myo5bP21271 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Myo5bP21271 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Myo5bP21271 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Myo5bP21271 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Myo5bP21271 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Myo5bP21271 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Myo5bP21271 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Myo5bP21271 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Myo5bP21271 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Myo5bP21271 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Myo5bP21271 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Myo5bP21271 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Myo5bP21271 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Myo5bP21271 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Myo5bP21271 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Myo5bP21271 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Myo5bP21271 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Myo5bP21271 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Myo5bP21271 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Myo5bP21271 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Myo5bP21271 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Myo5bP21271 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Myo5bP21271 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Myo5bP21271 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Myo5bP21271 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Myo5bP21271 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Myo5bP21271 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Myo5bP21271 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Myo5bP21271 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Myo5bP21271 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Myo5bP21271 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Myo5bP21271 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Myo5bP21271 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Myo5bP21271 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Myo5bP21271 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Myo5bP21271 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Myo5bP21271 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Myo5bP21271 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Myo5bP21271 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Myo5bP21271 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Myo5bP21271 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Myo5bP21271 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Myo5bP21271 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Myo5bP21271 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Myo5bP21271 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Myo5bP21271 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Myo5bP21271 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Myo5bP21271 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Myo5bP21271 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Myo5bP21271 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Myo5bP21271 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Myo5bP21271 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Myo5bP21271 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Myo5bP21271 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Myo5bP21271 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Myo5bP21271 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Myo5bP21271 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Myo5bP21271 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Myo5bP21271 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Myo5bP21271 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Myo5bP21271 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Myo5bP21271 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Myo5bP21271 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Myo5bP21271 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Myo5bP21271 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Myo5bP21271 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Myo5bP21271 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Myo5bP21271 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Myo5bP21271 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Myo5bP21271 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Myo5bP21271 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Myo5bP21271 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Myo5bP21271 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Myo5bP21271 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Myo5bP21271 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Myo5bP21271 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms