Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fcer1aP20489 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms