Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18530 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18530 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18530 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18530 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18530 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18530 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18530 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18530 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18530 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18530 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18530 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
P18530 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18530 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18530 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
P18530 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
P18530 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
P18530 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
P18530 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
P18530 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
P18530 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
P18530 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18530 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
P18530 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18530 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18530 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
P18530 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18530 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18530 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18530 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18530 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18530 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
P18530 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18530 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18530 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18530 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18530 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
P18530 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18530 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18530 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18530 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
P18530 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
P18530 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
P18530 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18530 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
P18530 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
P18530 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18530 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18530 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18530 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18530 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18530 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18530 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
P18530 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18530 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18530 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18530 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18530 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18530 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18530 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18530 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
P18530 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18530 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18530 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18530 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18530 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18530 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18530 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18530 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18530 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
P18530 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18530 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18530 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
P18530 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18530 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18530 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18530 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18530 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18530 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18530 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18530 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18530 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18530 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18530 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18530 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18530 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18530 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18530 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18530 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18530 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18530 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18530 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18530 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
P18530 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18530 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18530 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18530 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18530 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18530 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
P18530 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms