Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 4933430L12Rik-201ENSMUST00000206788 1194 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Gm3250-201ENSMUST00000167358 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Gm3238-201ENSMUST00000168298 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Gm45875-201ENSMUST00000212178 781 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 Gm5257-201ENSMUST00000121823 790 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Sptan1P16546 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
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