Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Sipa1l3-215ENSMUST00000183096 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Kmt2a-202ENSMUST00000114689 16470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Slc45a4-207ENSMUST00000151288 7509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC8.27□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC8.27□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms