Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
DmdP11531 Auts2-216ENSMUST00000185450 144 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
DmdP11531 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
DmdP11531 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
DmdP11531 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
DmdP11531 Gm43997-201ENSMUST00000203986 1005 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
DmdP11531 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
DmdP11531 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
DmdP11531 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
DmdP11531 Gm14005-210ENSMUST00000225087 1413 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
DmdP11531 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
DmdP11531 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
DmdP11531 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
DmdP11531 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
DmdP11531 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
DmdP11531 Gm20822-201ENSMUST00000165756 687 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
DmdP11531 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
DmdP11531 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
DmdP11531 Olfr60-201ENSMUST00000075470 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
DmdP11531 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
DmdP11531 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
DmdP11531 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
DmdP11531 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
DmdP11531 Hsd3b3-204ENSMUST00000107019 1533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
DmdP11531 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
DmdP11531 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
DmdP11531 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
DmdP11531 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
DmdP11531 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
DmdP11531 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
DmdP11531 1700001J11Rik-201ENSMUST00000185917 759 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
DmdP11531 Gm6644-201ENSMUST00000186507 951 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
DmdP11531 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
DmdP11531 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
DmdP11531 Gm45469-201ENSMUST00000210468 854 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
DmdP11531 AC187103.3-201ENSMUST00000225725 646 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
DmdP11531 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
DmdP11531 Mrpl33-201ENSMUST00000031024 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
DmdP11531 Rpl3-201ENSMUST00000081650 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
DmdP11531 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
DmdP11531 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
DmdP11531 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
DmdP11531 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
DmdP11531 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
DmdP11531 Slc38a5-201ENSMUST00000033512 1868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
DmdP11531 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
DmdP11531 Lockd-205ENSMUST00000185152 496 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
DmdP11531 Lsm8-204ENSMUST00000201141 503 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
DmdP11531 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
DmdP11531 Atp5s-204ENSMUST00000220916 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
DmdP11531 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
DmdP11531 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
DmdP11531 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
DmdP11531 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
DmdP11531 Gm12461-201ENSMUST00000120231 1239 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
DmdP11531 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
DmdP11531 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
DmdP11531 2610016A17Rik-201ENSMUST00000185211 474 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
DmdP11531 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
DmdP11531 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
DmdP11531 Uqcc3-201ENSMUST00000096253 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
DmdP11531 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
DmdP11531 Gm15519-201ENSMUST00000120088 1566 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
DmdP11531 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
DmdP11531 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
DmdP11531 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
DmdP11531 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
DmdP11531 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
DmdP11531 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
DmdP11531 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
DmdP11531 Ankrd7-202ENSMUST00000115396 1157 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
DmdP11531 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
DmdP11531 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
DmdP11531 Gm37257-201ENSMUST00000194871 717 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
DmdP11531 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
DmdP11531 Gm45875-201ENSMUST00000212178 781 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
DmdP11531 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
DmdP11531 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
DmdP11531 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
DmdP11531 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
DmdP11531 Gm45012-201ENSMUST00000208323 1666 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
DmdP11531 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
DmdP11531 Gm37452-201ENSMUST00000194416 1160 ntBASIC11.58□□□□□ -0.55
DmdP11531 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.55
DmdP11531 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC11.58□□□□□ -0.55
DmdP11531 AC158392.3-201ENSMUST00000224271 1284 ntBASIC11.58□□□□□ -0.55
DmdP11531 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
DmdP11531 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
DmdP11531 Krtap12-1-201ENSMUST00000092370 656 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.55
DmdP11531 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
DmdP11531 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
DmdP11531 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
DmdP11531 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
DmdP11531 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
DmdP11531 Gm15707-201ENSMUST00000118804 996 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
DmdP11531 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
DmdP11531 Gm29304-201ENSMUST00000186555 695 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
DmdP11531 Gm29223-201ENSMUST00000188867 695 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
DmdP11531 Gm37921-201ENSMUST00000194333 695 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
DmdP11531 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms