Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P10404 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P10404 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P10404 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P10404 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P10404 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P10404 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P10404 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P10404 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P10404 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P10404 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P10404 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P10404 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P10404 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P10404 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P10404 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P10404 Gm44044-201ENSMUST00000205178 1089 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P10404 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P10404 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P10404 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P10404 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P10404 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P10404 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P10404 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P10404 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P10404 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P10404 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P10404 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P10404 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P10404 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P10404 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P10404 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P10404 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P10404 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P10404 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P10404 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P10404 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P10404 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P10404 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P10404 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P10404 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P10404 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P10404 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P10404 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P10404 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P10404 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P10404 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P10404 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P10404 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P10404 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P10404 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P10404 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P10404 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P10404 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P10404 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P10404 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P10404 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P10404 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P10404 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P10404 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P10404 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P10404 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P10404 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P10404 Pid1-205ENSMUST00000176720 450 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P10404 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P10404 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P10404 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P10404 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P10404 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P10404 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P10404 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P10404 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P10404 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P10404 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P10404 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P10404 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P10404 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P10404 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P10404 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P10404 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P10404 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P10404 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P10404 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P10404 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P10404 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P10404 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P10404 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P10404 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P10404 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P10404 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P10404 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
P10404 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P10404 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P10404 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P10404 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P10404 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P10404 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P10404 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P10404 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P10404 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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