Protein–RNA interactions for Protein: P09225

Lta, Lymphotoxin-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtaP09225 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
LtaP09225 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LtaP09225 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LtaP09225 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LtaP09225 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LtaP09225 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LtaP09225 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LtaP09225 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LtaP09225 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LtaP09225 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LtaP09225 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LtaP09225 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LtaP09225 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LtaP09225 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LtaP09225 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LtaP09225 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LtaP09225 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LtaP09225 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LtaP09225 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LtaP09225 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LtaP09225 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LtaP09225 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LtaP09225 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LtaP09225 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LtaP09225 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
LtaP09225 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
LtaP09225 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LtaP09225 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LtaP09225 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LtaP09225 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LtaP09225 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LtaP09225 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LtaP09225 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
LtaP09225 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
LtaP09225 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
LtaP09225 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
LtaP09225 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LtaP09225 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LtaP09225 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LtaP09225 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LtaP09225 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LtaP09225 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LtaP09225 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LtaP09225 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
LtaP09225 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LtaP09225 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LtaP09225 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LtaP09225 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
LtaP09225 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
LtaP09225 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LtaP09225 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LtaP09225 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LtaP09225 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LtaP09225 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LtaP09225 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LtaP09225 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LtaP09225 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LtaP09225 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LtaP09225 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
LtaP09225 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LtaP09225 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LtaP09225 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LtaP09225 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LtaP09225 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LtaP09225 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LtaP09225 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LtaP09225 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LtaP09225 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LtaP09225 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LtaP09225 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LtaP09225 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LtaP09225 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LtaP09225 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LtaP09225 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LtaP09225 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LtaP09225 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LtaP09225 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LtaP09225 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LtaP09225 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LtaP09225 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LtaP09225 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LtaP09225 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LtaP09225 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LtaP09225 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LtaP09225 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LtaP09225 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LtaP09225 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LtaP09225 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LtaP09225 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LtaP09225 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LtaP09225 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LtaP09225 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LtaP09225 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LtaP09225 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LtaP09225 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LtaP09225 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
LtaP09225 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LtaP09225 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LtaP09225 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LtaP09225 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms