Protein–RNA interactions for Protein: P09023

Hoxb6, Homeobox protein Hox-B6, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb6P09023 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Hoxb6P09023 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxb6P09023 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxb6P09023 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxb6P09023 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxb6P09023 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxb6P09023 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxb6P09023 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxb6P09023 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxb6P09023 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxb6P09023 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxb6P09023 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxb6P09023 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxb6P09023 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxb6P09023 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxb6P09023 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxb6P09023 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb6P09023 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb6P09023 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb6P09023 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb6P09023 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb6P09023 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb6P09023 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb6P09023 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb6P09023 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb6P09023 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb6P09023 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb6P09023 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb6P09023 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb6P09023 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb6P09023 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb6P09023 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb6P09023 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb6P09023 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb6P09023 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb6P09023 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb6P09023 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb6P09023 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb6P09023 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb6P09023 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb6P09023 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb6P09023 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb6P09023 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb6P09023 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb6P09023 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb6P09023 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb6P09023 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb6P09023 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb6P09023 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb6P09023 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb6P09023 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb6P09023 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb6P09023 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb6P09023 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb6P09023 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb6P09023 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb6P09023 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb6P09023 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb6P09023 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb6P09023 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb6P09023 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb6P09023 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb6P09023 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb6P09023 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb6P09023 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb6P09023 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxb6P09023 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxb6P09023 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxb6P09023 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxb6P09023 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxb6P09023 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxb6P09023 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxb6P09023 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxb6P09023 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxb6P09023 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxb6P09023 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxb6P09023 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxb6P09023 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxb6P09023 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxb6P09023 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxb6P09023 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxb6P09023 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxb6P09023 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxb6P09023 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxb6P09023 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxb6P09023 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxb6P09023 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxb6P09023 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxb6P09023 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxb6P09023 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxb6P09023 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxb6P09023 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxb6P09023 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxb6P09023 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxb6P09023 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxb6P09023 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxb6P09023 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxb6P09023 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxb6P09023 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxb6P09023 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms