Protein–RNA interactions for Protein: P08121

Col3a1, Collagen alpha-1(III) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col3a1P08121 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col3a1P08121 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col3a1P08121 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col3a1P08121 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col3a1P08121 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col3a1P08121 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col3a1P08121 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col3a1P08121 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col3a1P08121 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col3a1P08121 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col3a1P08121 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col3a1P08121 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col3a1P08121 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col3a1P08121 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col3a1P08121 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Col3a1P08121 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col3a1P08121 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col3a1P08121 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col3a1P08121 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Col3a1P08121 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col3a1P08121 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Col3a1P08121 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Col3a1P08121 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col3a1P08121 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Col3a1P08121 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Col3a1P08121 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col3a1P08121 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col3a1P08121 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col3a1P08121 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col3a1P08121 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col3a1P08121 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col3a1P08121 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col3a1P08121 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col3a1P08121 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col3a1P08121 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col3a1P08121 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col3a1P08121 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col3a1P08121 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Col3a1P08121 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col3a1P08121 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col3a1P08121 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col3a1P08121 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col3a1P08121 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Col3a1P08121 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Col3a1P08121 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col3a1P08121 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col3a1P08121 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col3a1P08121 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col3a1P08121 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col3a1P08121 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col3a1P08121 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col3a1P08121 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col3a1P08121 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col3a1P08121 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col3a1P08121 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col3a1P08121 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col3a1P08121 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col3a1P08121 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col3a1P08121 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col3a1P08121 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col3a1P08121 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col3a1P08121 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col3a1P08121 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col3a1P08121 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col3a1P08121 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col3a1P08121 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Col3a1P08121 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col3a1P08121 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col3a1P08121 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Col3a1P08121 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col3a1P08121 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col3a1P08121 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col3a1P08121 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Col3a1P08121 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col3a1P08121 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col3a1P08121 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col3a1P08121 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col3a1P08121 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Col3a1P08121 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col3a1P08121 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col3a1P08121 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col3a1P08121 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col3a1P08121 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col3a1P08121 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Col3a1P08121 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col3a1P08121 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col3a1P08121 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col3a1P08121 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col3a1P08121 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Col3a1P08121 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Col3a1P08121 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Col3a1P08121 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Col3a1P08121 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Col3a1P08121 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Col3a1P08121 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Col3a1P08121 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Col3a1P08121 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Col3a1P08121 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col3a1P08121 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col3a1P08121 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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