Protein–RNA interactions for Protein: P04212

T-cell receptor beta chain V region LB2, mousemouse

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04212 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P04212 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P04212 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P04212 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P04212 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
P04212 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
P04212 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P04212 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P04212 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P04212 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P04212 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P04212 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
P04212 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
P04212 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P04212 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
P04212 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P04212 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P04212 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P04212 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P04212 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
P04212 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P04212 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P04212 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P04212 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
P04212 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P04212 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P04212 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P04212 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P04212 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P04212 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P04212 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
P04212 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
P04212 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
P04212 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P04212 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
P04212 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
P04212 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
P04212 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P04212 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P04212 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P04212 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
P04212 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
P04212 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
P04212 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P04212 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P04212 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
P04212 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
P04212 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
P04212 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P04212 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
P04212 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
P04212 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P04212 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P04212 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P04212 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P04212 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
P04212 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P04212 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P04212 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P04212 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P04212 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P04212 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
P04212 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P04212 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
P04212 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P04212 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P04212 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
P04212 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P04212 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P04212 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
P04212 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P04212 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P04212 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P04212 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P04212 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P04212 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P04212 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P04212 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P04212 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P04212 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P04212 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P04212 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P04212 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P04212 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P04212 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P04212 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P04212 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
P04212 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P04212 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P04212 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P04212 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P04212 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P04212 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P04212 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P04212 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P04212 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P04212 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
P04212 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
P04212 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
P04212 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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