Protein–RNA interactions for Protein: O88874

Ccnk, Cyclin-K, mousemouse

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Length 554 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnkO88874 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CcnkO88874 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CcnkO88874 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CcnkO88874 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
CcnkO88874 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CcnkO88874 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CcnkO88874 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
CcnkO88874 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
CcnkO88874 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CcnkO88874 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
CcnkO88874 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
CcnkO88874 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CcnkO88874 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
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CcnkO88874 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CcnkO88874 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CcnkO88874 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CcnkO88874 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
CcnkO88874 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CcnkO88874 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
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