Protein–RNA interactions for Protein: O88545

Cops6, COP9 signalosome complex subunit 6, mousemouse

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Length 324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops6O88545 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cops6O88545 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cops6O88545 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cops6O88545 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cops6O88545 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cops6O88545 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cops6O88545 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Cops6O88545 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cops6O88545 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cops6O88545 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cops6O88545 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cops6O88545 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cops6O88545 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cops6O88545 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cops6O88545 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Cops6O88545 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cops6O88545 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Cops6O88545 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cops6O88545 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cops6O88545 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cops6O88545 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Cops6O88545 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cops6O88545 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cops6O88545 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cops6O88545 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Cops6O88545 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cops6O88545 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cops6O88545 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cops6O88545 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cops6O88545 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cops6O88545 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cops6O88545 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cops6O88545 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cops6O88545 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cops6O88545 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cops6O88545 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cops6O88545 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Cops6O88545 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cops6O88545 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cops6O88545 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cops6O88545 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Cops6O88545 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cops6O88545 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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Cops6O88545 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cops6O88545 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC15.05■□□□□ -0
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Cops6O88545 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cops6O88545 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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Cops6O88545 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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Cops6O88545 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cops6O88545 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cops6O88545 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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Cops6O88545 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cops6O88545 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cops6O88545 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cops6O88545 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cops6O88545 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cops6O88545 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cops6O88545 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cops6O88545 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cops6O88545 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cops6O88545 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cops6O88545 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cops6O88545 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cops6O88545 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cops6O88545 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cops6O88545 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cops6O88545 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cops6O88545 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cops6O88545 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cops6O88545 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Cops6O88545 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cops6O88545 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cops6O88545 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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