Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms