Protein–RNA interactions for Protein: O54956

Pole2, DNA polymerase epsilon subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole2O54956 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pole2O54956 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pole2O54956 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pole2O54956 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pole2O54956 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pole2O54956 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pole2O54956 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pole2O54956 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pole2O54956 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pole2O54956 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pole2O54956 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pole2O54956 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pole2O54956 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pole2O54956 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 221.1 ms