Protein–RNA interactions for Protein: O35963

Rab33b, Ras-related protein Rab-33B, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab33bO35963 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab33bO35963 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab33bO35963 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab33bO35963 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab33bO35963 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab33bO35963 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab33bO35963 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab33bO35963 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab33bO35963 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab33bO35963 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab33bO35963 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rab33bO35963 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab33bO35963 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab33bO35963 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab33bO35963 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab33bO35963 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab33bO35963 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab33bO35963 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab33bO35963 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab33bO35963 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab33bO35963 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab33bO35963 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab33bO35963 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab33bO35963 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab33bO35963 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab33bO35963 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab33bO35963 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab33bO35963 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab33bO35963 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab33bO35963 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab33bO35963 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab33bO35963 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab33bO35963 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab33bO35963 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab33bO35963 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab33bO35963 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab33bO35963 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab33bO35963 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab33bO35963 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab33bO35963 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab33bO35963 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab33bO35963 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab33bO35963 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab33bO35963 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab33bO35963 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab33bO35963 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab33bO35963 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab33bO35963 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab33bO35963 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab33bO35963 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab33bO35963 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab33bO35963 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab33bO35963 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab33bO35963 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab33bO35963 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab33bO35963 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab33bO35963 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab33bO35963 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab33bO35963 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab33bO35963 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab33bO35963 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rab33bO35963 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab33bO35963 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab33bO35963 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab33bO35963 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab33bO35963 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab33bO35963 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab33bO35963 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab33bO35963 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab33bO35963 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab33bO35963 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab33bO35963 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab33bO35963 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab33bO35963 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab33bO35963 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab33bO35963 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab33bO35963 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab33bO35963 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab33bO35963 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab33bO35963 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab33bO35963 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab33bO35963 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab33bO35963 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab33bO35963 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab33bO35963 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab33bO35963 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab33bO35963 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab33bO35963 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab33bO35963 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab33bO35963 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab33bO35963 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab33bO35963 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab33bO35963 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab33bO35963 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab33bO35963 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab33bO35963 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab33bO35963 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab33bO35963 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab33bO35963 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rab33bO35963 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms