Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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FxnO35943 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
FxnO35943 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
FxnO35943 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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FxnO35943 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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FxnO35943 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
FxnO35943 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
FxnO35943 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
FxnO35943 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
FxnO35943 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
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FxnO35943 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FxnO35943 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FxnO35943 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FxnO35943 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FxnO35943 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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FxnO35943 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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FxnO35943 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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FxnO35943 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FxnO35943 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FxnO35943 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
FxnO35943 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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FxnO35943 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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FxnO35943 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FxnO35943 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
FxnO35943 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms