Protein–RNA interactions for Protein: O35348

Colq, Acetylcholinesterase collagenic tail peptide, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ColqO35348 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ColqO35348 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ColqO35348 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ColqO35348 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ColqO35348 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ColqO35348 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
ColqO35348 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC11.25□□□□□ -0.61
ColqO35348 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ColqO35348 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ColqO35348 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ColqO35348 Ccna1-204ENSMUST00000198320 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ColqO35348 AC154186.1-201ENSMUST00000227711 1597 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
ColqO35348 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ColqO35348 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ColqO35348 Gm45719-201ENSMUST00000207954 1662 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
ColqO35348 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ColqO35348 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ColqO35348 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ColqO35348 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ColqO35348 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ColqO35348 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ColqO35348 Gm23255-201ENSMUST00000102244 110 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
ColqO35348 Ighv7-1-201ENSMUST00000103474 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ColqO35348 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ColqO35348 Gm13700-201ENSMUST00000118624 1128 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
ColqO35348 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
ColqO35348 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ColqO35348 Gm16234-201ENSMUST00000124976 815 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ColqO35348 Gm14055-201ENSMUST00000130262 668 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ColqO35348 Gm12637-201ENSMUST00000130501 368 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ColqO35348 1700057H21Rik-202ENSMUST00000154530 506 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ColqO35348 Gm12484-201ENSMUST00000156311 581 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ColqO35348 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
ColqO35348 Gm17226-201ENSMUST00000166637 780 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ColqO35348 Gm3453-202ENSMUST00000178308 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ColqO35348 Gm3127-203ENSMUST00000178386 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ColqO35348 Gm2888-202ENSMUST00000178577 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ColqO35348 Gm3685-202ENSMUST00000179199 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ColqO35348 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ColqO35348 Gm5268-201ENSMUST00000189212 940 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
ColqO35348 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ColqO35348 Gm44366-201ENSMUST00000204933 674 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ColqO35348 Gm18706-201ENSMUST00000210053 1066 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
ColqO35348 Gm45379-201ENSMUST00000211772 549 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
ColqO35348 Abracl-203ENSMUST00000218994 425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ColqO35348 Gm6841-201ENSMUST00000220602 598 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
ColqO35348 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
ColqO35348 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
ColqO35348 Olfr1102-201ENSMUST00000055129 1063 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ColqO35348 Olfr1189-201ENSMUST00000090700 921 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ColqO35348 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ColqO35348 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ColqO35348 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ColqO35348 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ColqO35348 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ColqO35348 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ColqO35348 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ColqO35348 Lrrc3b-203ENSMUST00000223700 1426 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ColqO35348 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ColqO35348 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ColqO35348 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ColqO35348 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ColqO35348 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ColqO35348 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ColqO35348 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ColqO35348 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ColqO35348 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
ColqO35348 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ColqO35348 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ColqO35348 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ColqO35348 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ColqO35348 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ColqO35348 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ColqO35348 Gm37082-201ENSMUST00000192629 1927 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
ColqO35348 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ColqO35348 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ColqO35348 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ColqO35348 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ColqO35348 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ColqO35348 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ColqO35348 Gm12696-201ENSMUST00000122361 905 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
ColqO35348 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ColqO35348 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ColqO35348 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ColqO35348 Gm13572-201ENSMUST00000153675 559 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ColqO35348 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ColqO35348 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
ColqO35348 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
ColqO35348 2510017J16Rik-201ENSMUST00000198718 1263 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
ColqO35348 Gm43854-201ENSMUST00000200418 394 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
ColqO35348 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ColqO35348 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ColqO35348 Gm44507-201ENSMUST00000206249 343 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ColqO35348 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ColqO35348 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ColqO35348 AL929417.1-201ENSMUST00000214901 124 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
ColqO35348 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
ColqO35348 AC160105.1-201ENSMUST00000221931 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ColqO35348 AC154594.1-201ENSMUST00000225171 1273 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
ColqO35348 AC183092.2-201ENSMUST00000225542 1153 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms