Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sec22bO08547 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Sec22bO08547 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Sec22bO08547 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Sec22bO08547 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Sec22bO08547 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Sec22bO08547 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Sec22bO08547 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Sec22bO08547 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sec22bO08547 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sec22bO08547 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sec22bO08547 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms