Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
MsmbO08540 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
MsmbO08540 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
MsmbO08540 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
MsmbO08540 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
MsmbO08540 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
MsmbO08540 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
MsmbO08540 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
MsmbO08540 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
MsmbO08540 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
MsmbO08540 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
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