Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
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Usp35M0QWN7 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Usp35M0QWN7 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Usp35M0QWN7 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Usp35M0QWN7 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Usp35M0QWN7 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Usp35M0QWN7 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Usp35M0QWN7 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Usp35M0QWN7 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Usp35M0QWN7 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Usp35M0QWN7 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Usp35M0QWN7 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
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