Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Gm16833-202ENSMUST00000189204 672 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Synj2bp-202ENSMUST00000114201 1121 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms