Protein–RNA interactions for Protein: J3QPE5

Gm5849, Predicted gene 5849, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5849J3QPE5 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Bpifb9b-201ENSMUST00000088921 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Vamp5-203ENSMUST00000206154 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Chst15-202ENSMUST00000080215 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Pask-201ENSMUST00000027493 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Atl2-201ENSMUST00000068282 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Gm13126-201ENSMUST00000117079 3063 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Idua-202ENSMUST00000112563 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Pum1-201ENSMUST00000030315 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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Gm5849J3QPE5 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Gm8036-201ENSMUST00000118089 1718 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Ar-201ENSMUST00000052837 10048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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Gm5849J3QPE5 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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Gm5849J3QPE5 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
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Gm5849J3QPE5 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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Gm5849J3QPE5 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Gm16702-201ENSMUST00000181180 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Osmr-201ENSMUST00000022746 5491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Slc7a4-201ENSMUST00000063544 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Nrbp2-201ENSMUST00000019516 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm5849J3QPE5 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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Gm5849J3QPE5 Slco5a1-201ENSMUST00000115402 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
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