Protein–RNA interactions for Protein: J3QM54

Gm3727, Predicted gene 3727, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3727J3QM54 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3727J3QM54 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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