Protein–RNA interactions for Protein: J3KMP8

Gm21863, Predicted gene, 21863, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21863J3KMP8 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21863J3KMP8 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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