Protein–RNA interactions for Protein: H3BJN7

Gm20696, Predicted gene 20696, mousemouse

Predictions only

Length 74 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20696H3BJN7 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Gm20696H3BJN7 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Gm20696H3BJN7 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Gm20696H3BJN7 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Gm20696H3BJN7 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20696H3BJN7 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms