Protein–RNA interactions for Protein: G3X9N3

Pnmal2, MCG16539, mousemouse

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnmal2G3X9N3 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pnmal2G3X9N3 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pnmal2G3X9N3 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pnmal2G3X9N3 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pnmal2G3X9N3 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pnmal2G3X9N3 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pnmal2G3X9N3 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pnmal2G3X9N3 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pnmal2G3X9N3 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pnmal2G3X9N3 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pnmal2G3X9N3 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pnmal2G3X9N3 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pnmal2G3X9N3 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pnmal2G3X9N3 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pnmal2G3X9N3 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pnmal2G3X9N3 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pnmal2G3X9N3 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pnmal2G3X9N3 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pnmal2G3X9N3 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pnmal2G3X9N3 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pnmal2G3X9N3 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pnmal2G3X9N3 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pnmal2G3X9N3 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pnmal2G3X9N3 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pnmal2G3X9N3 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pnmal2G3X9N3 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pnmal2G3X9N3 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pnmal2G3X9N3 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pnmal2G3X9N3 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pnmal2G3X9N3 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pnmal2G3X9N3 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pnmal2G3X9N3 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pnmal2G3X9N3 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pnmal2G3X9N3 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pnmal2G3X9N3 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pnmal2G3X9N3 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pnmal2G3X9N3 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pnmal2G3X9N3 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pnmal2G3X9N3 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pnmal2G3X9N3 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pnmal2G3X9N3 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pnmal2G3X9N3 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pnmal2G3X9N3 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pnmal2G3X9N3 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pnmal2G3X9N3 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pnmal2G3X9N3 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pnmal2G3X9N3 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pnmal2G3X9N3 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pnmal2G3X9N3 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pnmal2G3X9N3 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pnmal2G3X9N3 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pnmal2G3X9N3 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pnmal2G3X9N3 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pnmal2G3X9N3 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pnmal2G3X9N3 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pnmal2G3X9N3 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pnmal2G3X9N3 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pnmal2G3X9N3 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pnmal2G3X9N3 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pnmal2G3X9N3 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pnmal2G3X9N3 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pnmal2G3X9N3 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pnmal2G3X9N3 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pnmal2G3X9N3 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pnmal2G3X9N3 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pnmal2G3X9N3 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pnmal2G3X9N3 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pnmal2G3X9N3 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pnmal2G3X9N3 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pnmal2G3X9N3 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pnmal2G3X9N3 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pnmal2G3X9N3 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pnmal2G3X9N3 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pnmal2G3X9N3 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pnmal2G3X9N3 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pnmal2G3X9N3 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pnmal2G3X9N3 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pnmal2G3X9N3 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pnmal2G3X9N3 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pnmal2G3X9N3 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pnmal2G3X9N3 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pnmal2G3X9N3 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pnmal2G3X9N3 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pnmal2G3X9N3 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pnmal2G3X9N3 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pnmal2G3X9N3 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pnmal2G3X9N3 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pnmal2G3X9N3 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pnmal2G3X9N3 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pnmal2G3X9N3 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pnmal2G3X9N3 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pnmal2G3X9N3 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pnmal2G3X9N3 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pnmal2G3X9N3 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pnmal2G3X9N3 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pnmal2G3X9N3 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pnmal2G3X9N3 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pnmal2G3X9N3 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pnmal2G3X9N3 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pnmal2G3X9N3 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms