Protein–RNA interactions for Protein: F8VPX6

Speer4a, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4aF8VPX6 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Speer4aF8VPX6 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Speer4aF8VPX6 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Speer4aF8VPX6 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Speer4aF8VPX6 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Speer4aF8VPX6 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Speer4aF8VPX6 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Speer4aF8VPX6 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Speer4aF8VPX6 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Speer4aF8VPX6 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Speer4aF8VPX6 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Speer4aF8VPX6 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Speer4aF8VPX6 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Speer4aF8VPX6 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Speer4aF8VPX6 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Speer4aF8VPX6 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Speer4aF8VPX6 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Speer4aF8VPX6 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Speer4aF8VPX6 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Speer4aF8VPX6 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Speer4aF8VPX6 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Speer4aF8VPX6 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Speer4aF8VPX6 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Speer4aF8VPX6 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Speer4aF8VPX6 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Speer4aF8VPX6 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Speer4aF8VPX6 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Speer4aF8VPX6 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Speer4aF8VPX6 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.04■□□□□ -0
Speer4aF8VPX6 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Speer4aF8VPX6 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Speer4aF8VPX6 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Speer4aF8VPX6 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Speer4aF8VPX6 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Speer4aF8VPX6 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Speer4aF8VPX6 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Speer4aF8VPX6 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Speer4aF8VPX6 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Speer4aF8VPX6 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Speer4aF8VPX6 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Speer4aF8VPX6 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Speer4aF8VPX6 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Speer4aF8VPX6 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Speer4aF8VPX6 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Speer4aF8VPX6 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Speer4aF8VPX6 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Speer4aF8VPX6 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Speer4aF8VPX6 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Speer4aF8VPX6 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Speer4aF8VPX6 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Speer4aF8VPX6 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Speer4aF8VPX6 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Speer4aF8VPX6 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Speer4aF8VPX6 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Speer4aF8VPX6 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Speer4aF8VPX6 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Speer4aF8VPX6 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Speer4aF8VPX6 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Speer4aF8VPX6 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Speer4aF8VPX6 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Speer4aF8VPX6 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Speer4aF8VPX6 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Speer4aF8VPX6 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Speer4aF8VPX6 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Speer4aF8VPX6 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Speer4aF8VPX6 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Speer4aF8VPX6 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Speer4aF8VPX6 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Speer4aF8VPX6 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Speer4aF8VPX6 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Speer4aF8VPX6 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Speer4aF8VPX6 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Speer4aF8VPX6 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Speer4aF8VPX6 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Speer4aF8VPX6 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Speer4aF8VPX6 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Speer4aF8VPX6 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Speer4aF8VPX6 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Speer4aF8VPX6 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Speer4aF8VPX6 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Speer4aF8VPX6 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Speer4aF8VPX6 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Speer4aF8VPX6 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Speer4aF8VPX6 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Speer4aF8VPX6 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Speer4aF8VPX6 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Speer4aF8VPX6 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Speer4aF8VPX6 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Speer4aF8VPX6 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Speer4aF8VPX6 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Speer4aF8VPX6 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Speer4aF8VPX6 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Speer4aF8VPX6 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Speer4aF8VPX6 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Speer4aF8VPX6 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Speer4aF8VPX6 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Speer4aF8VPX6 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Speer4aF8VPX6 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Speer4aF8VPX6 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Speer4aF8VPX6 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms