Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-M1F7CXU4 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.4 ms