Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm28048F7BCN0 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm28048F7BCN0 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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