Protein–RNA interactions for Protein: F6VKC7

Zfp988, Zinc finger protein 988, mousemouse

Predictions only

Length 633 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp988F6VKC7 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Zfp988F6VKC7 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.6 ms