Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm340F6RGI3 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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