Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Brd1E9PZ26 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Brd1E9PZ26 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Brd1E9PZ26 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Brd1E9PZ26 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brd1E9PZ26 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brd1E9PZ26 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brd1E9PZ26 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brd1E9PZ26 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brd1E9PZ26 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brd1E9PZ26 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brd1E9PZ26 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brd1E9PZ26 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brd1E9PZ26 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brd1E9PZ26 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Brd1E9PZ26 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Brd1E9PZ26 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Brd1E9PZ26 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brd1E9PZ26 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brd1E9PZ26 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Brd1E9PZ26 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Brd1E9PZ26 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Brd1E9PZ26 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brd1E9PZ26 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Brd1E9PZ26 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brd1E9PZ26 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Brd1E9PZ26 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Brd1E9PZ26 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Brd1E9PZ26 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Brd1E9PZ26 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brd1E9PZ26 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brd1E9PZ26 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Brd1E9PZ26 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brd1E9PZ26 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Brd1E9PZ26 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brd1E9PZ26 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brd1E9PZ26 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brd1E9PZ26 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Brd1E9PZ26 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Brd1E9PZ26 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brd1E9PZ26 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Brd1E9PZ26 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brd1E9PZ26 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brd1E9PZ26 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brd1E9PZ26 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Brd1E9PZ26 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brd1E9PZ26 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brd1E9PZ26 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brd1E9PZ26 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brd1E9PZ26 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brd1E9PZ26 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Brd1E9PZ26 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brd1E9PZ26 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brd1E9PZ26 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Brd1E9PZ26 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Brd1E9PZ26 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brd1E9PZ26 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brd1E9PZ26 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brd1E9PZ26 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brd1E9PZ26 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Brd1E9PZ26 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Brd1E9PZ26 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Brd1E9PZ26 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brd1E9PZ26 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brd1E9PZ26 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Brd1E9PZ26 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brd1E9PZ26 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Brd1E9PZ26 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Brd1E9PZ26 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Brd1E9PZ26 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brd1E9PZ26 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brd1E9PZ26 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Brd1E9PZ26 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brd1E9PZ26 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Brd1E9PZ26 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brd1E9PZ26 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brd1E9PZ26 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Brd1E9PZ26 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brd1E9PZ26 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brd1E9PZ26 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Brd1E9PZ26 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Brd1E9PZ26 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Brd1E9PZ26 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Brd1E9PZ26 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Brd1E9PZ26 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Brd1E9PZ26 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Brd1E9PZ26 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Brd1E9PZ26 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Brd1E9PZ26 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Brd1E9PZ26 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Brd1E9PZ26 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Brd1E9PZ26 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Brd1E9PZ26 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Brd1E9PZ26 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Brd1E9PZ26 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Brd1E9PZ26 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Brd1E9PZ26 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Brd1E9PZ26 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Brd1E9PZ26 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Brd1E9PZ26 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms