Protein–RNA interactions for Protein: E9PW72

Gm3002, Predicted gene 3002, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3002E9PW72 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3002E9PW72 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3002E9PW72 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3002E9PW72 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3002E9PW72 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3002E9PW72 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3002E9PW72 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3002E9PW72 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3002E9PW72 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3002E9PW72 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3002E9PW72 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3002E9PW72 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3002E9PW72 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3002E9PW72 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3002E9PW72 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3002E9PW72 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3002E9PW72 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3002E9PW72 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3002E9PW72 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3002E9PW72 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3002E9PW72 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3002E9PW72 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3002E9PW72 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3002E9PW72 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3002E9PW72 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3002E9PW72 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3002E9PW72 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3002E9PW72 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3002E9PW72 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3002E9PW72 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3002E9PW72 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3002E9PW72 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3002E9PW72 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3002E9PW72 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3002E9PW72 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3002E9PW72 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3002E9PW72 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3002E9PW72 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3002E9PW72 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3002E9PW72 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3002E9PW72 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3002E9PW72 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3002E9PW72 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3002E9PW72 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3002E9PW72 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3002E9PW72 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3002E9PW72 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3002E9PW72 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3002E9PW72 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3002E9PW72 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3002E9PW72 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3002E9PW72 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3002E9PW72 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3002E9PW72 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3002E9PW72 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3002E9PW72 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3002E9PW72 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3002E9PW72 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3002E9PW72 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3002E9PW72 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3002E9PW72 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3002E9PW72 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3002E9PW72 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3002E9PW72 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3002E9PW72 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3002E9PW72 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3002E9PW72 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3002E9PW72 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3002E9PW72 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3002E9PW72 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3002E9PW72 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3002E9PW72 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3002E9PW72 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3002E9PW72 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3002E9PW72 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3002E9PW72 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3002E9PW72 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gm3002E9PW72 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gm3002E9PW72 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gm3002E9PW72 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
Gm3002E9PW72 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gm3002E9PW72 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gm3002E9PW72 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3002E9PW72 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3002E9PW72 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3002E9PW72 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3002E9PW72 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3002E9PW72 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3002E9PW72 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3002E9PW72 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3002E9PW72 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3002E9PW72 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3002E9PW72 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3002E9PW72 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3002E9PW72 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3002E9PW72 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3002E9PW72 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3002E9PW72 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3002E9PW72 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3002E9PW72 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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