Protein–RNA interactions for Protein: E9PVA8

Gcn1, eIF-2-alpha kinase activator GCN1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcn1E9PVA8 2700038G22Rik-201ENSMUST00000181574 1375 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Gm14052-201ENSMUST00000121434 1031 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Gm5976-201ENSMUST00000180794 996 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Gm9523-201ENSMUST00000199146 1159 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 D5Ertd605e-201ENSMUST00000201128 1081 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Sectm1b-202ENSMUST00000081499 1222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 AC166361.2-201ENSMUST00000219269 1415 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Skint7-202ENSMUST00000106568 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Tmprss11c-202ENSMUST00000196462 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Gm29918-201ENSMUST00000205635 138 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Gm18124-201ENSMUST00000210695 706 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 AC170597.1-201ENSMUST00000221956 440 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Eloc-208ENSMUST00000188641 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Gm14227-201ENSMUST00000119431 629 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Gm16184-201ENSMUST00000162324 573 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Gm43249-201ENSMUST00000200464 458 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Tpi-rs4-201ENSMUST00000213734 720 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Fthl17a-201ENSMUST00000048382 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Rab29-202ENSMUST00000112386 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Gm12774-201ENSMUST00000117881 416 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Gm15866-202ENSMUST00000152116 914 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Gm26610-201ENSMUST00000181529 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Prss1-201ENSMUST00000031910 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Defb12-201ENSMUST00000062113 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Klk1b24-201ENSMUST00000073713 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Klk1b21-201ENSMUST00000085455 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Tekt2-202ENSMUST00000102616 1542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Cyp2a21-ps-201ENSMUST00000206638 1471 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Fas-202ENSMUST00000112472 555 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gcn1E9PVA8 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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