Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Ccndbp1-208ENSMUST00000171260 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc6D3YZP9 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc6D3YZP9 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc6D3YZP9 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc6D3YZP9 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc6D3YZP9 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc6D3YZP9 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc6D3YZP9 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc6D3YZP9 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc6D3YZP9 Gm2721-201ENSMUST00000222380 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc6D3YZP9 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc6D3YZP9 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc6D3YZP9 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc6D3YZP9 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc6D3YZP9 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc6D3YZP9 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc6D3YZP9 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc6D3YZP9 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc6D3YZP9 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc6D3YZP9 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc6D3YZP9 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc6D3YZP9 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc6D3YZP9 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc6D3YZP9 Matr3-216ENSMUST00000190653 1846 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc6D3YZP9 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc6D3YZP9 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc6D3YZP9 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc6D3YZP9 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc6D3YZP9 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc6D3YZP9 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc6D3YZP9 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc6D3YZP9 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc6D3YZP9 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc6D3YZP9 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc6D3YZP9 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc6D3YZP9 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc6D3YZP9 Gm16459-201ENSMUST00000121443 686 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc6D3YZP9 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc6D3YZP9 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc6D3YZP9 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc6D3YZP9 Gm23400-201ENSMUST00000174994 102 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc6D3YZP9 Gm26463-201ENSMUST00000175065 101 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc6D3YZP9 Gm24332-201ENSMUST00000175102 102 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc6D3YZP9 Gm25959-201ENSMUST00000175112 102 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc6D3YZP9 Gm22475-201ENSMUST00000175169 102 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc6D3YZP9 Gm22903-201ENSMUST00000175193 102 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc6D3YZP9 Gm25070-201ENSMUST00000175237 102 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc6D3YZP9 Gm24159-201ENSMUST00000175264 102 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc6D3YZP9 Gm25299-201ENSMUST00000175283 102 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc6D3YZP9 Gm23798-201ENSMUST00000175560 102 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc6D3YZP9 Gm23802-201ENSMUST00000175565 102 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc6D3YZP9 Gm25708-201ENSMUST00000177687 102 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc6D3YZP9 Gm24370-201ENSMUST00000178007 102 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc6D3YZP9 Gm23049-201ENSMUST00000178068 102 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc6D3YZP9 Gm28019-201ENSMUST00000178138 101 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
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Ccdc6D3YZP9 Gm24975-201ENSMUST00000178492 101 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc6D3YZP9 Gm23189-201ENSMUST00000178954 102 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
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Ccdc6D3YZP9 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc6D3YZP9 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc6D3YZP9 Gm45094-201ENSMUST00000207013 617 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc6D3YZP9 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Ccdc6D3YZP9 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc6D3YZP9 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc6D3YZP9 Prok2-201ENSMUST00000008273 594 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc6D3YZP9 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc6D3YZP9 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc6D3YZP9 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc6D3YZP9 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc6D3YZP9 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc6D3YZP9 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc6D3YZP9 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc6D3YZP9 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc6D3YZP9 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc6D3YZP9 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc6D3YZP9 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc6D3YZP9 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc6D3YZP9 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc6D3YZP9 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc6D3YZP9 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc6D3YZP9 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc6D3YZP9 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc6D3YZP9 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc6D3YZP9 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc6D3YZP9 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc6D3YZP9 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc6D3YZP9 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc6D3YZP9 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc6D3YZP9 Pfdn5-203ENSMUST00000165671 830 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc6D3YZP9 Gm37197-201ENSMUST00000195607 401 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc6D3YZP9 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc6D3YZP9 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc6D3YZP9 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc6D3YZP9 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc6D3YZP9 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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