Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
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Clip3B9EHT4 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Clip3B9EHT4 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Clip3B9EHT4 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Clip3B9EHT4 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Clip3B9EHT4 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Clip3B9EHT4 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Clip3B9EHT4 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Clip3B9EHT4 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Clip3B9EHT4 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Clip3B9EHT4 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Clip3B9EHT4 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Clip3B9EHT4 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Clip3B9EHT4 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Clip3B9EHT4 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Clip3B9EHT4 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Clip3B9EHT4 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Clip3B9EHT4 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Clip3B9EHT4 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Clip3B9EHT4 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Clip3B9EHT4 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Clip3B9EHT4 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Clip3B9EHT4 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Clip3B9EHT4 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Clip3B9EHT4 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Clip3B9EHT4 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Clip3B9EHT4 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Clip3B9EHT4 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Clip3B9EHT4 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Clip3B9EHT4 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Clip3B9EHT4 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
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Clip3B9EHT4 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Clip3B9EHT4 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Clip3B9EHT4 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
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