Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Rd3lB2RV38 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms