Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Prrt4B2RU40 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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