Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brpf1B2RRD7 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 4930518I15Rik-201ENSMUST00000099141 1331 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms