Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
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Trabd2bB1ATG9 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Trabd2bB1ATG9 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Trabd2bB1ATG9 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Trabd2bB1ATG9 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Trabd2bB1ATG9 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Trabd2bB1ATG9 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Trabd2bB1ATG9 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Trabd2bB1ATG9 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Trabd2bB1ATG9 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Trabd2bB1ATG9 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Trabd2bB1ATG9 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trabd2bB1ATG9 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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