Protein–RNA interactions for Protein: A2AKX3

Setx, Probable helicase senataxin, mousemouse

Predictions only

Length 2,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SetxA2AKX3 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SetxA2AKX3 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SetxA2AKX3 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
SetxA2AKX3 Gm17796-201ENSMUST00000189015 1213 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
SetxA2AKX3 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SetxA2AKX3 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
SetxA2AKX3 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SetxA2AKX3 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SetxA2AKX3 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SetxA2AKX3 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SetxA2AKX3 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SetxA2AKX3 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SetxA2AKX3 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SetxA2AKX3 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SetxA2AKX3 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SetxA2AKX3 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SetxA2AKX3 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SetxA2AKX3 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SetxA2AKX3 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SetxA2AKX3 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SetxA2AKX3 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SetxA2AKX3 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SetxA2AKX3 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
SetxA2AKX3 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SetxA2AKX3 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SetxA2AKX3 Trav10d-201ENSMUST00000103646 406 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SetxA2AKX3 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
SetxA2AKX3 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SetxA2AKX3 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SetxA2AKX3 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SetxA2AKX3 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
SetxA2AKX3 Vmn1r206-201ENSMUST00000187140 1135 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SetxA2AKX3 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SetxA2AKX3 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
SetxA2AKX3 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SetxA2AKX3 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SetxA2AKX3 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SetxA2AKX3 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SetxA2AKX3 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SetxA2AKX3 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SetxA2AKX3 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SetxA2AKX3 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SetxA2AKX3 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SetxA2AKX3 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SetxA2AKX3 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SetxA2AKX3 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SetxA2AKX3 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SetxA2AKX3 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SetxA2AKX3 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SetxA2AKX3 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SetxA2AKX3 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SetxA2AKX3 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SetxA2AKX3 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SetxA2AKX3 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SetxA2AKX3 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SetxA2AKX3 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SetxA2AKX3 Gm11619-201ENSMUST00000117474 237 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
SetxA2AKX3 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SetxA2AKX3 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SetxA2AKX3 Rpl13-ps4-201ENSMUST00000194776 628 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
SetxA2AKX3 4933430L12Rik-201ENSMUST00000206788 1194 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SetxA2AKX3 Zfp445-205ENSMUST00000214626 1220 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SetxA2AKX3 Tnfrsf18-201ENSMUST00000040274 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SetxA2AKX3 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SetxA2AKX3 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SetxA2AKX3 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
SetxA2AKX3 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SetxA2AKX3 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SetxA2AKX3 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SetxA2AKX3 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SetxA2AKX3 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SetxA2AKX3 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SetxA2AKX3 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SetxA2AKX3 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SetxA2AKX3 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SetxA2AKX3 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SetxA2AKX3 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SetxA2AKX3 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SetxA2AKX3 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
SetxA2AKX3 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SetxA2AKX3 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SetxA2AKX3 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SetxA2AKX3 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SetxA2AKX3 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SetxA2AKX3 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
SetxA2AKX3 Gm26647-201ENSMUST00000180816 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SetxA2AKX3 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SetxA2AKX3 Gm45310-201ENSMUST00000210436 275 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
SetxA2AKX3 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
SetxA2AKX3 Mir326-201ENSMUST00000083637 95 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
SetxA2AKX3 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SetxA2AKX3 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SetxA2AKX3 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SetxA2AKX3 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SetxA2AKX3 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SetxA2AKX3 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SetxA2AKX3 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SetxA2AKX3 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SetxA2AKX3 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SetxA2AKX3 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms