Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB1

Ccdc183, Coiled-coil domain-containing protein 183, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc183A2AJB1 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc183A2AJB1 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc183A2AJB1 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc183A2AJB1 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc183A2AJB1 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc183A2AJB1 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc183A2AJB1 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc183A2AJB1 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc183A2AJB1 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc183A2AJB1 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc183A2AJB1 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc183A2AJB1 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc183A2AJB1 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc183A2AJB1 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc183A2AJB1 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc183A2AJB1 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc183A2AJB1 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc183A2AJB1 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc183A2AJB1 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc183A2AJB1 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc183A2AJB1 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc183A2AJB1 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc183A2AJB1 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc183A2AJB1 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc183A2AJB1 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc183A2AJB1 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc183A2AJB1 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc183A2AJB1 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc183A2AJB1 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc183A2AJB1 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc183A2AJB1 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc183A2AJB1 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc183A2AJB1 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc183A2AJB1 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc183A2AJB1 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc183A2AJB1 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc183A2AJB1 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc183A2AJB1 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc183A2AJB1 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc183A2AJB1 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc183A2AJB1 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc183A2AJB1 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc183A2AJB1 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc183A2AJB1 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc183A2AJB1 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc183A2AJB1 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc183A2AJB1 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc183A2AJB1 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc183A2AJB1 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc183A2AJB1 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc183A2AJB1 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc183A2AJB1 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc183A2AJB1 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc183A2AJB1 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc183A2AJB1 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc183A2AJB1 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc183A2AJB1 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc183A2AJB1 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc183A2AJB1 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc183A2AJB1 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc183A2AJB1 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc183A2AJB1 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc183A2AJB1 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc183A2AJB1 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc183A2AJB1 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc183A2AJB1 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc183A2AJB1 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc183A2AJB1 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc183A2AJB1 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc183A2AJB1 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc183A2AJB1 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc183A2AJB1 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc183A2AJB1 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc183A2AJB1 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc183A2AJB1 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc183A2AJB1 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc183A2AJB1 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc183A2AJB1 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc183A2AJB1 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc183A2AJB1 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc183A2AJB1 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc183A2AJB1 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc183A2AJB1 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc183A2AJB1 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc183A2AJB1 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc183A2AJB1 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc183A2AJB1 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc183A2AJB1 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc183A2AJB1 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc183A2AJB1 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc183A2AJB1 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc183A2AJB1 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc183A2AJB1 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc183A2AJB1 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc183A2AJB1 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc183A2AJB1 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc183A2AJB1 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc183A2AJB1 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc183A2AJB1 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc183A2AJB1 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.7 ms