Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ubl3Q9Z2M6 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms